Фонд має право:
одержувати і використовувати відповідно до законодавства кошти Державного фонду охорони навколишнього природного середовища у складі державного бюджету та інші кошти державного бюджету, передбачені Фонду для стимулювання і фінансування природоохоронних заходів;
одержувати і використовувати в установленому порядку благодійні внески, гранти, дарунки, технічну та іншу допомогу, яка надається українськими, іноземними і міжнародними організаціями;
розглядати в установленому Мінприроди порядку запити юридичних осіб усіх форм власності, які планують здійснити та здійснюють природоохоронні заходи за рахунок коштів Державного фонду охорони навколишнього природного середовища у складі державного бюджету та інших коштів, визначених у державному бюджеті на відповідні цілі;
утворювати регіональні відділення, необхідні для виконання покладених на нього завдань;
одержувати від органів виконавчої влади в установленому порядку інформацію, необхідну для виконання покладених на нього завдань;
укладати договори з українськими та іноземними юридичними і фізичними особами для виконання покладених на нього завдань;
надавати методологічні, організаційні, консультаційні, інформаційні, представницькі та інші послуги відповідно до покладених на нього завдань, одержувати плату за послуги і використовувати її відповідно до законодавства;
залучати в установленому порядку до роботи спеціалістів для розгляду питань, що належать до його компетенції.