Начальник гарнізонної гауптвахти підпорядкований військовому комендантові гарнізону. Він відповідає за підтримання порядку на гауптвахті, за додержання законності і порядку тримання заарештованих, а також за збереження майна та обладнання гауптвахти. Йому підпорядкований начальник варти на гауптвахті.
Начальник гарнізонної гауптвахти зобов'язаний:
приймати на гауптвахту заарештованих, перевіряти наявність і правильність оформлення відповідних документів, а також вести облік заарештованих і стежити за неухильним виконанням правил їх тримання;
зберігати записки про арешт і забезпечувати збереження документів та речей заарештованих;
проводити інструктаж начальника варти на гауптвахті з питань організації та несення служби, звертаючи увагу на практичні дії у разі заворушень, спроб самогубства чи втечі, вручати йому список заарештованих, яких тримають на гауптвахті;
перевіряти не рідше одного разу на тиждень проведення ранкових оглядів і вечірніх перевірок заарештованих;
установлювати порядок виведення та охорони заарештованих під час умивання, справляння природних потреб та прогулянки;
давати начальникові варти письмові розпорядження про звільнення заарештованих після закінчення строку їх арешту, а також про відправлення заарештованих за розпорядженням військового коменданта гарнізону до лазні, лікувальної установи й на вимогу слідчого або суду;
вести облік роботи заарештованих із зазначенням часу, місця та виду робіт;
стежити за санітарним і протипожежним станом гауптвахти й вартового приміщення;
постійно дбати про належний стан камер тримання заарештованих, технічних засобів охорони, обладнання та інвентаря гауптвахти, вартового приміщення та постів;
розглядати в межах своїх повноважень або передавати у порядку підпорядкованості пропозиції, заяви, прохання і скарги, які надходять від заарештованих;
організовувати й проводити заняття з стройової підготовки та вивчення статутів заарештованими;
щодня перевіряти правильність несення служби вартою на гауптвахті, роблячи про це відповідні записи у постовій відомості;
щодня доповідати військовому комендантові гарнізону про стан військової дисципліни на гауптвахті, кількість прийнятих за день заарештованих, наявність вільних місць, негайно повідомляти про надзвичайні події, які сталися на гауптвахті.
Військовий комендант на транспорті