Головний державний інспектор з карантину рослин України, головні державні інспектори з карантину рослин Республіки Крим, областей та міст керують службою з карантину рослин, здійснюють державний контроль і несуть відповідальність за проведення карантинних заходів відповідно на території України, Республіки Крим, областей та міст.
У разі виявлення карантинних об'єктів головний державний інспектор з карантину рослин України, головний державний інспектор з карантину рослин Республіки Крим, державні інспектори з карантину рослин впродовж 24 годин вносять подання про введення особливого карантинного режиму до відповідного органу місцевого чи регіонального самоврядування, органу державної виконавчої влади або Кабінету Міністрів України і мають право:
давати обов'язкові для виконання розпорядження щодо здійснення карантинних заходів;
затримувати транспортні засоби, які можуть сприяти поширенню карантинних об'єктів;
знезаражувати підкарантинні матеріали та об'єкти;
вилучати, знищувати або направляти на технічне перероблення підкарантинні матеріали;
видавати відповідні висновки органам страхування.