Для запобігання несанкціонованому і неконтрольованому проникненню на територію, де запроваджено режим спеціальної митної зони, або за її межі фізичних осіб, транспортних засобів, а також ввезенню і вивезенню товарів та інших предметів територія спеціальної економічної зони "Порт Крим" повинна бути огороджена за периметром і облаштована згідно з вимогами Державної митної служби України.
Території зон митного контролю для спеціальної економічної зони "Порт Крим", їхні межі та режим переміщення через їхню територію товарів, транспортних засобів, громадян встановлюються Державною митною службою України.