Територія СЕЗ огороджується за периметром і облаштовується відповідно до вимог Держмитслужби. Організація робіт з облаштування митної інфраструктури і огородження території СЕЗ та їх фінансування здійснюється органом господарського розвитку.
Спеціальний митний режим на території СЕЗ запроваджується з дня затвердження Держмитслужбою акта приймання - передачі в експлуатацію об'єктів митної інфраструктури.