1. Держава гарантує збереження у повному обсязі всіх майнових і немайнових прав суб'єктів СЕЗ "Миколаїв" у разі її ліквідації.
2. Спори між органами управління СЕЗ "Миколаїв", суб'єктами СЕЗ "Миколаїв" та ліквідаційною комісією, що можуть виникнути у зв'язку з ліквідацією СЕЗ "Миколаїв", підлягають розгляду в судах України, а спори за участю іноземних суб'єктів господарської діяльності - у судах за погодженням сторін, у тому числі за кордоном.