Скасування реєстрації суб'єкта СЕЗ проводиться її адміністрацією:
за ініціативою суб'єкта СЕЗ згідно із заявою;
у разі скасування державної реєстрації його як суб'єкта підприємницької діяльності в установленому законодавством порядку;
у разі закінчення строку дії договору (контракту) про реалізацію інвестиційного проекту;
у разі дострокового розірвання зазначеного договору (контракту) в установленому порядку.
Скасування реєстрації суб'єкта СЕЗ не є підставою для скасування державної реєстрації його як суб'єкта підприємницької діяльності.