Основними організаційно-методологічними принципами проведення сільськогосподарського перепису є:
регулярність і періодичність з метою забезпечення послідовності та зіставлення отримуваних результатів;
загальність і одномоментність, що передбачають охоплення опитуванням респондентів, на яких поширюється дія цього Закону, та отримання від них даних за станом на єдиний установлений момент часу;
єдність програми і методів його проведення та оброблення результатів;
конфіденційність первинних даних, що передбачає забезпечення їх захисту в порядку, встановленому законом;
централізоване керівництво і координація всіх робіт, пов'язаних пов’язаних з підготовкою, проведенням, обробленням, узагальненням, поширенням та використанням його результатів.