До повноважень центрального органу виконавчої влади, що реалізує державну політику у сфері рибного господарства, відповідно до покладених на нього завдань належать:
вжиття заходів щодо забезпечення збереження запасів анадромних видів риб у виключній (морській) економічній зоні України;
здійснення державного нагляду (контролю) у галузі охорони, використання та відтворення водних живих ресурсів у виключній (морській) економічній зоні України, територіальному морі, внутрішніх водоймах України та у водах за межами юрисдикції України щодо рибальських суден, що плавають під Державним Прапором України, відповідно до міжнародних договорів України;
здійснення державного контролю технічного стану рибозахисних споруд, проведення рибозахисних заходів на водозабірних та інженерних спорудах меліоративних систем;
здійснення контролю за дотриманням правил рибальства;
здійснення контролю за дотриманням лімітів і нормативів використання водних біоресурсів;
здійснення контролю за дотриманням правил використання об'єктів тваринного світу в частині водних біоресурсів;
складання протоколів та розгляд справ про адміністративні правопорушення у випадках, передбачених законом;
ведення обліку суб'єктів господарювання, які здійснюють виробництво консервів і пресервів із водних біоресурсів, присвоєння таким суб'єктам номерів;
ведення реєстру рибальських суден;
акредитація органів сертифікації персоналу рибальських суден;
видача дипломів, кваліфікаційних сертифікатів та документів про відповідність компаній і суден вимогам Міжнародної конвенції про стандарти підготовки, сертифікації персоналу риболовних суден та несення вахти 1995 року ( 995_707 ), Міжнародної конвенції з охорони людського життя на морі 1974 року ( 995_251 ), Міжнародного кодексу з управління безпечною експлуатацією суден і попередженням забруднення 1993 року ( 995_304 );
видача свідоцтва про право плавання суден під Державним Прапором України;
видача дозволів, сертифікатів, довідок міжнародного зразка відповідно до вимог міжнародних договорів України з питань ведення рибного промислу і торгівлі рибою та морепродуктами;
видача свідоцтва про мінімальний склад екіпажу, свідоцтва про тимчасове виключення судна з Державного суднового реєстру України;
видача свідоцтва про стабільність і надводний борт судна, що не підлягає нагляду класифікаційного товариства;
видача суднового білета для суден, що не підлягають нагляду класифікаційного товариства;
здійснення державного контролю за безпекою мореплавства флоту рибної промисловості;
контроль за дотриманням кваліфікаційних вимог (стандартів) щодо підготовки та сертифікації персоналу рибальських суден;
здійснення контролю за достовірністю подання суб'єктами рибного господарства, пов'язаними з добуванням і використанням водних біоресурсів, звітних даних про обсяги використання водних біоресурсів;
здійснення контролю за дотриманням порядку придбання або збуту осетрових видів риб та продукції з них;
здійснення державного контролю за системою моніторингу рибальських суден;
здійснення технічного нагляду та нагляду за дотриманням вимог міжнародних договорів України стосовно технічного стану суден рибної промисловості;
реєстрація рибальських суден, що не підлягають нагляду класифікаційного товариства, у Судновій книзі України;
ведення реєстру сертифікатів, дипломів, кваліфікаційних посвідчень командного складу та членів персоналу рибальського судна;
запровадження спеціальних форм статистичної звітності в галузі рибного господарства ( z1126-12 ) щодо водних біоресурсів згідно з міжнародними стандартами та нормами, забезпечення обміну такою інформацією з відповідними міжнародними організаціями згідно із законодавством та міжнародними договорами України;
виконання функцій уповноваженого органу, який взаємодіє з Європейським Союзом, органами влади іноземних держав (їх компетентними органами і організаціями) з питань дотримання вимог системи попередження та ліквідації незаконного, непідзвітного та нерегульованого рибальства;
здійснення у випадках, передбачених законом, ліцензування певних видів господарської діяльності;
розроблення порядку штучного розведення (відтворення), вирощування водних біоресурсів та їх використання ( z1270-12 );
погодження науковим установам програм на проведення дослідного вилову водних біоресурсів;
участь у проведенні експертизи проектів будівництва нових та розширення, реконструкції, технічного переозброєння діючих підприємств, документації з перепрофілювання, консервації та ліквідації діючих підприємств, окремих цехів, виробництв та інших промислових і господарських об'єктів, виконання інших робіт, а також впровадження нової техніки, технологій, матеріалів і речовин, що впливають або можуть вплинути на стан рибогосподарських водних об'єктів (їх частин);
надання в установленому порядку пропозицій та здійснення контролю щодо рівневого режиму роботи рибогосподарських водних об'єктів, що забезпечує повноцінне існування гідробіонтів;
ведення реєстру гідротехнічних споруд рибогосподарських водних об'єктів щодо їх технічної експлуатації та використання з метою досягнення максимальної рибопродуктивності;
погодження видачі дозволів на будівельні, днопоглиблювальні роботи, видобування піску і гравію, прокладання кабелів, трубопроводів та інших комунікацій на землях водного фонду;
погодження режимів рибогосподарської експлуатації водних об'єктів та контроль за діяльністю спеціальних товарних рибних господарств;
встановлення в установленому порядку заборони вилову водних біоресурсів у рибогосподарських водних об'єктах (їх частинах) та забезпечення контролю за дотриманням заборони;
видача документів дозвільного характеру у сфері рибного господарства;
здійснення розподілу лімітів спеціального використання водних біоресурсів на квоти добування;
здійснення в установленому порядку обліку (реєстрації) зовнішньоекономічних договорів (контрактів) стосовно рибогосподарської продукції групи 3, підгруп 1603, 1604, 1605 УКТ ЗЕД ( 2371а-14 ) для визначення рівня індикативних цін на такі товари, проведення у межах своїх повноважень моніторингу внутрішнього і зовнішнього ринків рибопродукції, здійснення державного регулювання внутрішнього ринку рибопродукції, надання дозволів на імпорт водних біоресурсів, продуктів переробки з них за кількісним та видовим складом;
участь у веденні державного кадастру тваринного світу;
здійснення у межах своїх повноважень у порядку, визначеному законом, співробітництва з державами-донорами та міжнародними організаціями з питань залучення міжнародної технічної допомоги в рибогосподарський комплекс України;
співпраця з Комітетом рибного господарства Сільськогосподарської та харчової організації ООН, органами влади іноземних держав та міжнародними організаціями з питань управління рибальством, аквакультури, безпеки мореплавства на морі, запобігання забрудненню навколишнього природного середовища, охорони праці у рибному господарстві;
здійснення державного регулювання у галузі аквакультури, забезпечення формування раціонального ринку вітчизняної продукції аквакультури, здійснення науково-технологічної політики селекції в аквакультурі;
забезпечення підготовки, перепідготовки, дипломування та сертифікації фахівців у галузі рибного господарства згідно з вимогами міжнародних договорів України, інших нормативно-правових актів;
здійснення контролю за діяльністю галузевої системи науково-технічної інформації;
забезпечення функціонування морських рибних портів;
співпраця з класифікаційними товариствами;
розподіл між користувачами водних біоресурсів квот добування, у тому числі:
у районах дії міжнародних організацій з управління рибальством, членом яких є Україна відповідно до міжнародних договорів України;
у водах за межами районів управління таких організацій відповідно до міжнародно-правових зобов'язань України;
у водах, що перебувають під юрисдикцією прибережних держав, якщо це передбачено міжнародними договорами України;
участь у розробленні та здійсненні заходів з нарощення експортного потенціалу рибної галузі, відновлення традиційних та освоєння нових ринків збуту продукції;
участь у заходах з контролю якості та безпеки продуктів рибальства, харчової продукції під час її виробництва, зберігання, транспортування, реалізації, використання та утилізації;
розроблення програми науково-технічного розвитку галузі та організація її виконання;
здійснення організаційного забезпечення підготовки, перепідготовки і підвищення кваліфікації фахівців у галузі рибного господарства у вищих навчальних закладах, що належать до сфери управління його; { Абзац п'ятдесят п'ятий статті 9 із змінами, внесеними згідно із Законом N 5462-VI ( 5462-17 ) від 16.10.2012 }
здійснення атестації педагогічних працівників навчальних закладів I рівня акредитації, що належать до сфери управління його; { Абзац п'ятдесят шостий статті 9 із змінами, внесеними згідно із Законом N 5462-VI ( 5462-17 ) від 16.10.2012 }
сприяння підвищенню енергоефективності підприємств, установ та організацій, що належать до сфери управління його; { Абзац п'ятдесят сьомий статті 9 із змінами, внесеними згідно із Законом N 5462-VI ( 5462-17 ) від 16.10.2012 }
виконання в межах повноважень інших функцій з управління об'єктами державної власності, що належать до сфери управління його; { Абзац п'ятдесят восьмий статті 9 із змінами, внесеними згідно із Законом N 5462-VI ( 5462-17 ) від 16.10.2012 }
здійснення відповідно до законодавства повноважень державного замовника науково-дослідних робіт, координація їх проведення, сприяння впровадженню у виробництво наукових розробок та поширенню передового досвіду; { Статтю 9 доповнено новим абзацом згідно із Законом N 5462-VI ( 5462-17 ) від 16.10.2012 }
здійснення державної атестації наукових установ, що належать до сфери його управління; { Статтю 9 доповнено новим абзацом згідно із Законом N 5462-VI ( 5462-17 ) від 16.10.2012 }
здійснення інших повноважень відповідно до закону.