Координація діяльності центральних органів виконавчої влади, інших державних органів щодо розроблення проекту річної національної програми, моніторингу та оцінювання результатів її виконання здійснюється Кабінетом Міністрів України.
Узгодження та координація заходів, здійснюваних центральними органами виконавчої влади, іншими державними органами щодо визначення стратегічної мети реформ, відповідних цілей, очікуваних результатів, пріоритетних завдань, підготовка відповідних рекомендацій, методичних матеріалів здійснюються Комісією з питань координації євроатлантичної інтеграції України.
Координуюча роль у процесі розроблення річної національної програми покладається на Урядовий офіс координації європейської та євроатлантичної інтеграції Секретаріату Кабінету Міністрів України (далі - Урядовий офіс координації європейської та євроатлантичної інтеграції).
До роботи з розроблення проекту річної національної програми, моніторингу та оцінювання результатів її виконання можуть залучатися в установленому порядку експерти, у тому числі іноземні, вчені, а також представники інститутів громадянського суспільства.