Контроль за результатами виконання PhD-проекту МОН здійснює шляхом подання закладом щорічних звітів за формами, затвердженими МОН.
Звіти подаються в електронній формі з використанням відповідних модулів Національної електронної науково-інформаційної системи. Експертиза звітної документації за проектами проводиться щонайменше двома експертами, які провадять свою діяльність відповідно до Закону України “Про наукову і науково-технічну експертизу”.
Звіти про виконання PhD-проекту, що містять інформацію з обмеженим доступом, оформлюються відповідно до встановлених для цього виду інформації вимог, зокрема вимог у сфері охорони державної таємниці.
МОН здійснює контроль за виконанням PhD-проекту з урахуванням очікуваних результатів, запланованих у проекті.