Координатором експериментального проекту є МОН.
Учасниками експериментального проекту є:
Фонд розвитку інновацій, який координує взаємодію стартап-шкіл, надає інформаційно-консультаційну підтримку, здійснює спільні заходи популяризаційного характеру;
заклади вищої освіти, наукові установи - переможці конкурсного відбору науково-технічних проектів для визначення переліку закладів вищої освіти, наукових установ, на базі яких буде створено мережу стартап-шкіл - інкубаторів - акселераторів (далі - конкурс), які реалізують науково-технічний проект із створення та забезпечення функціонування стартап-школи, а також заклади вищої освіти, наукові установи, які повідомили МОН про створення стартап-школи за рахунок коштів спеціального фонду та інших джерел, не заборонених законодавством, незалежно від результатів конкурсного відбору.
Учасниками конкурсу можуть бути заклади вищої освіти, наукові установи незалежно від форми власності та підпорядкування.