Етапи виконання науково-технічного проекту включають:
затвердження положення про центр, у якому визначаються основні завдання, функції, структура, органи управління, партнери та форми їх участі, порядок фінансування та взаємодії, матеріально-технічна база, регламент доступу до наукового обладнання та користування ним; підготовка (у тому числі інженерна) приміщень для розташування та забезпечення умов роботи центру, закупівля обладнання та/або устаткування, його встановлення та пусконалагодження - протягом першого року реалізації експериментального проекту;
виконання основних завдань та функцій центру, визначених відповідно до технічного завдання згідно із договором, - протягом другого року реалізації експериментального проекту.
За результатами виконання науково-технічного проекту заклад вищої освіти звітує про виконання основних завдань та функцій центру, визначених відповідно до технічного завдання у договорі. За результатами звіту МОН приймає рішення щодо доцільності подальшого фінансування такого проекту.