На третьому етапі відбору проводиться основна перевірка, спеціальна перевірка кандидата, до якої залучаються СБУ, МВС, ДСА та інші державні органи.
Центр рекрутингу після прибуття кандидата в Україну визначає дату та місце проведення психофізіологічного дослідження із застосуванням поліграфа, після чого повідомляє про це кандидату не менш як за один день до дня проведення такого дослідження.
Спеціальна перевірка кандидатів у межах визначених законом повноважень проводиться у строк до 15 діб СБУ та відповідними центральними органами виконавчої влади, діяльність яких спрямовується і координується Кабінетом Міністрів України через Міністра внутрішніх справ.
За результатами проведення основної перевірки, спеціальної перевірки кандидата з урахуванням інформації, одержаної від зазначених державних органів, Центр рекрутингу приймає рішення про успішне або неуспішне проходження кандидатом основної перевірки.