Бюджетні кошти спрямовуються на поповнення статутного капіталу Фонду інновацій для надання фінансової підтримки стартапам у формі грантів.
Перерахування бюджетних коштів здійснюється Мінекономіки платіжним дорученням із реєстраційного рахунка Мінекономіки, відкритого у Казначействі, на рахунок за субрахунком 3553 “Рахунки інших клієнтів Казначейства”, відкритий Фондом інновацій за його місцезнаходженням в органах Казначейства.