Комплексна перевірка проводиться не рідше одного разу на п’ять років на підставі рішення Кабінету Міністрів України, прийнятого за результатом розгляду звернення уповноваженого органу. Зазначене звернення надсилається Кабінету Міністрів України уповноваженим органом не пізніше ніж за один місяць до завершення п’ятирічного періоду, щодо якого не проводилася комплексна перевірка стосовно кожної окремої угоди про розподіл продукції.
Таке звернення повинно містити найменування угоди про розподіл продукції та період, щодо якого проводиться комплексна перевірка; перелік питань для проведення комплексної перевірки; пропозиції щодо посадового складу комісії відповідно до компетенції органів виконавчої влади, зокрема представників:
Міненерго;
Мінекономіки;
Держгеонадр;
ДПС (у разі звернення інвестора до ДПС);
Держпраці;
Держаудитслужби;
Держекоінспекції;
уповноваженого органу.
Для виконання покладених на комісію функцій можуть залучатися інші органи виконавчої влади (за визначенням головуючого органу).