До виняткової компетенції наглядової ради належить:
прийняття нових програм підтримки приватних малих і середніх підприємств;
затвердження річних звітів НУФ та заслуховування звітів про аудиторські перевірки;
прийняття рішень про прийом чи виключення засновників і учасників НУФ;
призначення виконавчого директора НУФ;
збільшення та зменшення статутного фонду;
вибір організації, що має провадити поточну діяльність з питань управління коштами НУФ і встановлення умов для залучення такої організації;
установлення розмірів адміністративної маржі;
залучення коштів від українських, іноземних та міжнародних кредиторів.