Ліквідацію НУФ здійснює ліквідаційна комісія, призначена його засновниками. Кожний із засновників делегує до складу ліквідаційної комісії двох представників. З моменту призначення ліквідаційної комісії до неї переходять повноваження з управління майном та коштами НУФ.