Фахівці Експертної служби МВС, які беруть участь у проведенні державної реєстрації ТЗ у ТСЦ МВС, підпорядковуються керівникам ДНДЕКЦ та НДЕКЦ, а в частині виконання своїх посадових обов’язків, пов’язаних з участю в проведенні державної реєстрації ТЗ, – керівництву територіальних органів з надання сервісних послуг МВС та їх відповідних підрозділів.