Члени Міжконфесійної ради мають право:
1) брати участь у засіданнях Міжконфесійної ради;
2) делегувати представників своєї організації до структур (комісій, експертних груп тощо), які створюються за рішенням Міжконфесійної ради;
3) отримувати в установленому порядку всю інформацію, що стосується діяльності Міжконфесійної ради;
4) бути поінформованими та/або письмово запрошеними на засідання Міжконфесійної ради та інші заходи, що здійснюються за її участю;
5) інформувати голову Міжконфесійної ради про святкові дні своєї організації;
6) уносити пропозиції щодо розгляду актуальних питань на засіданні Міжконфесійної ради;
7) ініціювати залучення фахівців (експертів) до вивчення та вирішення питань, що розглядаються на засіданнях Міжконфесійної ради;
8) у разі незгоди члена Міжконфесійної ради з прийнятим нею рішенням його власна позиція зазначається в протоколі.