Міжконфесійну раду створено з метою підготовки рекомендацій, пропозицій, надання фахових консультацій з питань удосконалення діяльності Служб військового капеланства, забезпечення досягнення міжконфесійної злагоди та порозуміння у сфері організації заходів, спрямованих на задоволення духовно-релігійних потреб військовослужбовців і працівників Національної гвардії України (далі - НГУ), Державної прикордонної служби України (далі - Держприкордонслужба) та членів їхніх сімей.