Міжконфесійна рада у своїй роботі керується Конституцією України, законами України, указами Президента України та постановами Верховної Ради України, прийнятими відповідно до Конституції та законів України, актами Кабінету Міністрів України, наказами МВС, іншими нормативно-правовими актами та цим Положенням.