До повноважень центрального органу виконавчої влади з питань аграрної політики належать:
здійснення фінансування робіт з ідентифікації та реєстрації тварин;
установлення порядку ідентифікації та реєстрації тварин, порядку оформлення і видачі ідентифікаційних документів;
визначення складу інформації, що подається для внесення до Єдиного державного реєстру тварин;
встановлення порядку ведення Єдиного державного реєстру тварин та користування його даними;
вирішення інших питань у сфері ідентифікації та реєстрації тварин відповідно до закону.