Із запровадженням в державі особливого періоду працівники усіх ланок єдиної транспортної системи України вважаються мобілізованими відповідно до законодавства про мобілізацію.
Забезпечення функціонування усіх видів транспорту, технічного прикриття та відбудови шляхів сполучення в особливий період покладається на Міністерство транспорту України, якому надається право залучати для виконання цих завдань структурні підрозділи та транспортні засоби підприємств (об'єднань), установ і організацій незалежно від форм власності.
Управління трубопровідним транспортом в особливий період здійснюється відповідно до законодавства про трубопровідний транспорт.
Управління міським електротранспортом, у тому числі метрополітеном, щодо перевезень в особливий період покладається на відповідні місцеві органи виконавчої влади та виконавчі органи рад.
Міністерство транспорту України забезпечує переведення транспорту і транспортної інфраструктури на режим роботи в особливий період.
Із запровадженням в державі особливого періоду підприємства (об'єднання), установи та організації транспорту і транспортної інфраструктури незалежно від форм власності переходять на режим роботи в особливий період. Їх керівники несуть персональну відповідальність за виконання мобілізаційних завдань і функціонування підприємств (об'єднань), установ та організацій в особливий період.
Управління єдиною транспортною системою України в особливий період здійснює Міністерство транспорту України.
Для здійснення управління використовуються автоматизовані системи управління, пункти управління Міністерства транспорту України та канали зв'язку усіх форм власності.
Безпосереднє управління ланками транспортної системи здійснюють їх керівники, місцеві органи виконавчої влади та виконавчі органи рад. Оповіщення Міністерства транспорту України та інших ланок транспортної системи здійснюється через загальну систему оповіщення України відповідно до порядку, який затверджується Кабінетом Міністрів України.