До повноважень Ради міністрів Автономної Республіки Крим у сфері формування, збереження та використання екомережі належать:
а) участь у розробленні та забезпеченні виконання схеми формування екомережі Автономної Республіки Крим;
б) координація діяльності органів виконавчої влади Автономної Республіки Крим - виконавців Загальнодержавної програми формування національної екомережі України на 2000-2015 роки;
в) здійснення контролю за використанням коштів, що надходять на реалізацію заходів щодо формування, збереження та використання екомережі.