Порушення вимог цього Закону і прийнятих на його основі нормативно-правових актів тягне за собою цивільну, адміністративну, дисциплінарну або кримінальну відповідальність згідно із законом.
Відповідальність несуть особи, які винні у:
приховуванні або перекрученні інформації, що могло спричинити або спричинило загрозу життю та здоров'ю людини чи навколишньому природному середовищу;
недотриманні або порушенні вимог регламентів, санітарних норм і правил використання, транспортування, зберігання, реалізації ГМО;
використанні незареєстрованих ГМО або продукції, отриманої з їх використанням (за винятком науково-дослідних цілей);
порушенні правил утилізації та знищення ГМО;
невиконанні законних вимог посадових осіб, які здійснюють державний нагляд і контроль.
Законом може бути встановлена відповідальність і за інші види порушень законодавства України в галузі генетично-інженерної діяльності.