Держатель Реєстру забезпечує:
1) розроблення засобів організаційного, методологічного та програмно-технічного ведення Реєстру;
2) збереження та захист інформації Реєстру відповідно до Закону України «Про захист інформації в інформаційно-комунікаційних системах».
3) організацію електронної інформаційної взаємодії Реєстру з іншими публічними електронними реєстрами та інформаційно-комунікаційними системами — через систему електронної взаємодії державних електронних інформаційних ресурсів «Трембіта» відповідно до Порядку електронної (технічної та інформаційної) взаємодії, затвердженого постановою Кабінету Міністрів України від 08 вересня 2016 року № 606, а у разі відсутності технічної можливості передачі даних із використанням зазначеної системи — з використанням інших інформаційно-комунікаційних систем за умови дотримання вимог щодо захисту інформації відповідно до статті 8 та пункту 1 - 1 статті 13 Закону України «Про захист інформації в інформаційно-комунікаційних системах»;
4) надання та контроль доступу до Реєстру;
5) збереження, автоматичне резервування та відновлення даних, що містяться або передавалися до Реєстру, а також безперебійний доступ до нього;
6) уповноваження посадових осіб Адміністрації судноплавства здійснювати функції публічного реєстратора Реєстру, зупинення або припинення таких повноважень;
7) доступ користувачів до вебпорталу Реєстру на безоплатній основі цілодобово сім днів на тиждень, крім випадків проведення модернізації або планових і позапланових профілактичних та/або технічних робіт, пов’язаних з усуненням технічних та/або методологічних недоліків чи технічного збою в роботі;
8) здійснення інших повноважень, передбачених Законом України «Про публічні електронні реєстри» та іншими нормативно-правовими актами.