Регулювання виконання підприємством зобов'язань щодо досягнення результатів інноваційного проекту та повернення інноваційних коштів полягає в розробці економіко-організаційних заходів задля усунення розбіжностей між плановими та фактичними показниками проекту, спрямованих на покращення фінансового стану підприємства.