Контроль за діяльністю підприємства розпочинається з моменту надання інноваційних коштів та/або основних фондів в лізинг і полягає в проведенні оцінки звітності підприємства на предмет виявлення розбіжностей між плановими та фактичними показниками проекту, змін в фінансово-економічному стані підприємства тощо.