Розпорядженням по Департаменту інформатизації для забезпечення роботи системного ЦГКІ призначаються адміністратор ЦГКІ та його оператор (оператори, якщо платіжна система потребує організації багатозмінної роботи). Розмежування доступу персоналу здійснюється за допомогою внутрішньої системи захисту інформації Національного банку.