Транспортні ключі генеруються системним ЦГКІ окремо для кожного учасника НСМЕП та використовуються для безпечного транспортування апаратно-програмних засобів захисту інформації карткової системи (модулі безпеки, платіжні та службові картки) від одного до іншого учасника НСМЕП відповідно до технології НСМЕП.