Комісія проводить свої засідання не рідше одного разу в рік по черзі в Україні й у Республіці Казахстан під головуванням Голови частини приймаючої Сторони. Терміни проведення засідань узгоджуються Сторонами не пізніше ніж за місяць до дати проведення засідання. З ініціативи однієї зі Сторін може бути скликане позачергове засідання Комісії. Позачергове засідання скликається за умови, якщо Сторона, що виступила з ініціативою скликання засідання, за місяць до запропонованої дати проведення засідання, повідомить у писемній формі іншу Сторону про причину скликання і повідомить перелік питань, що пропонуються на розгляд.