Комісія є постійно діючим органом, що відповідно до покладеного на нього функціями представляє Україну і Республіку Казахстан у їхніх взаєминах і забезпечує виконання зобов'язань країн, що випливають з міждержавних і міжурядових двосторонніх Угод і домовленостей.