СКВ здійснює контроль за виконанням адміністрацією морських, річкових портів, відкритих для міжнародних зв'язків, власниками суден або уповноважених ними органів (осіб), установами і службами, які розташовані в портах (прикордонного, митного та ін.), вимог, зазначених у пунктах 22 - 25, 27, 33 Правил санітарної охорони території України ( 696-99-п ).