Дисциплінарні скарги реєструються секретаріатом Комісії.
Рішення, дії чи бездіяльність прокурора в межах кримінального процесу можуть бути оскаржені виключно в порядку, встановленому Кримінальним процесуальним кодексом України. Якщо за результатами розгляду скарги на рішення, дії чи бездіяльність прокурора в межах кримінального процесу встановлено факти порушення прокурором прав осіб або вимог закону, таке рішення може бути підставою для дисциплінарного провадження.
Дисциплінарні скарги щодо дій (поведінки) прокурорів, пов'язані з виконанням ними адміністративних функцій, спрямовуються до Ради прокурорів України.
Дисциплінарні скарги щодо прокурора повертаються без розгляду, якщо до Комісії надійшло повідомлення від керівника органу прокуратури, в якому прокурор обіймав посаду, про його смерть, та документи, що це підтверджують.
Дисциплінарні скарги без зазначення місця проживання, не підписані автором (авторами), а також такі, з яких неможливо встановити авторство, визнаються анонімними і розгляду не підлягають.
Анонімні дисциплінарні скарги, у яких не зазначено прокурора, на дії якого скаржаться, за наявності адреси повертаються заявнику.
Проект відповіді на вказані дисциплінарні скарги готує секретаріат Комісії.