Зони митного контролю в морських та річкових портах розташовуються в межах, відведених адміністрацією цих портів, територій та акваторій.
Порядок створення та функціонування зон митного контролю у морських та річкових портах визначається Кабінетом Міністрів України ( 1947-2002-п ).