Рішення фармакотерапевтичної комісії вважаються правомочними, якщо в засіданні фармакотерапевтичної комісії брали участь більш ніж дві третини членів фармакотерапевтичної комісії. Рішення фармакотерапевтичної комісії приймається відкритим голосуванням простою більшістю голосів членів фармакотерапевтичної комісії, присутніх на засіданні. При рівній кількості голосів голос голови є ухвальним. Рішення фармакотерапевтичної комісії оформляється протоколом, який підписують її голова та секретар.