Центр перебуватиме під виключним керівництвом співробітника служби інформації НАТО - директора Центру, призначеного НАТО. Він є підзвітним Північноатлантичній Раді НАТО та діє у тісному співробітництві з Послом призначеного контактного Посольства НАТО в Україні.