Компетенція Комісії поширюється на Дунай згідно з статтею 2. В компетенцію Комісії входить:
a) нагляд за виконанням постанов цієї Конвенції;
b) складання загального плану основних робіт в інтересах судноплавства на базі пропозицій і проектів придунайських держав і спеціальних річкових Адміністрацій (статті 20 і 21), а також складання загального кошторису витрат, що відносяться до цих робіт;
c) виконання робіт у випадках, передбачених статтею 4;
d) консультація і рекомендації придунайським державам, що стосуються виконання робіт, зазначених у пункті "b" даної статті, з врахуванням при цьому технічних і економічних інтересів, планів і можливостей зазначених держав;
e) консультація і рекомендація спеціальним річковим Адміністраціям (статті 20 і 21) і обмін з ними інформацією;
f) встановлення єдиної системи навігаційної шляхової обстановки на всій судноплавній течії Дунаю, а також, з урахуванням специфічних умов окремих ділянок, основних положень про плавання по Дунаю, включаючи основні положення лоцманської служби;
g) уніфікація правил річкового нагляду;
h) координація гідрометеорологічної служби на Дунаї, видання єдиного гідрологічного бюлетеня і гідрологічних прогнозів, короткотермінових і довготермінових, для Дунаю;
i) статистика судноплавства на Дунаї з питань, що входять в компетенцію Комісії;
j) видання довідників, лоцій, навігаційних карт і атласів для потреб судноплавства;
k) складання і затвердження бюджету Комісії, а також встановлення і стягнення зборів, передбачених статтею 10.