Проведення повного родинного аналізу здійснюють за етапами:
зіставлення факторів потомка з материнськими;
зіставлення факторів потомка, які відсутні у матері, з факторами батька. Якщо в батька не виявлені фактори, що відсутні у матері, це вказує на заперечення того, що записаний плідник дійсно є батьком потомка, який перевіряється.