Основний курс - це комбіноване, безперервне тривале лікування антибактеріальними препаратами та патогенетичними засобами хворих на туберкульоз, розраховане на вилікування процесу в умовах стаціонару, санаторію і амбулаторно. Основний курс може бути закінчений не раніше ніж через 6 місяців після згасання процесу при великих залишкових змінах і не раніше ніж через 3 місяці - при малих.
Мінімальний термін основного курсу при ефективному лікуванні хворих на вперше виявлений деструктивний туберкульоз та туберкульоз з бактеріовиділенням, а також при рецидивах деструктивного туберкульозу та рецидивах з бактеріовиділенням повинен бути не менше 6-8, якщо протягом перших 2-4 місяців використовувались комбінації із 4-5 протитуберкульозних препаратів - ізоніазиду, рифампіцину, піразинаміду, стрептоміцину і (або) етамбутолу, а в наступні 3-5 місяців - 2 або 3 із них, в основному ізоніазид і рифампіцин щоденно або інтермітуючим методом. При менш інтенсивних режимах хіміотерапії і в разі мало ефективного лікування основний курс за погодженням з фтизіохірургом проводжується до 9-12 місяців.
При відсутності мікобактерій туберкульозу та деструкції мінімальний термін основного курсу хіміотерапії при ефективному лікуванні повинен бути не менше 4-6 місяців, якщо протягом перших 2 місяців використовувались 3 препарати, в основному ізоніазид, рифампіцин і піразинамід, а в наступні 2-4 місяці - 2 препарати, переважно ізоніазид і рифампіцин. В іншіх випадках основний курс продовжується до 7-9 місяців.
Основний курс хіміотерапії може бути закінчений не раніше ніж через 4 місяці після згасання процесу при великих залишкових змінах і не раніше ніж через 2 місяці - при малих.
При хронічному деструктивному туберкульозі легень з бактеріовиділенням основний курс хіміотерапії повинен тривати 12 - 18 місяців. Вона складається із 4 - 6 індивідуально підібраних протитуберкульозних препаратів згідно із чутливістю мікобактерій туберкульозу із числа таких як ізоніазид, рифампіцин, піразинамід, етамбутол, стрептоміцин, канаміцин, етіонамід та ін. Препарати призначаються як щоденно, так і інтермітуюче: кількість препаратів, прийнятих за 1 день, не може перевищувати 4. На заключному етапі лікування, після стійкого припинення бактеріовиділення, інтенсивність хіміотерапії зменшується. Не менше одного разу в 5 - 6 місяців хворих повинен консультувати фтизіохірург.