Головні Прикордонні Уповноважені здійснюють такі завдання:
а) забезпечують належне виконання Угод з прикордонних питань, укладених між Договірними Сторонами;
b) керують виконанням завдань щодо співпраці та взаємної допомоги у сфері охорони державного кордону, контролю за перетинанням державного кордону особами, транспортними засобами та вантажами й підтримання режиму кордону;
с) оцінюють загальний стан охорони кордону, контролю за перетинанням державного кордону особами, транспортними засобами та вантажами й режиму кордону, співробітництва та подання взаємної допомоги і вживають заходів до поглиблення співробітництва;
d) керують діяльністю Прикордонних Уповноважених і координують її;
е) затверджують протоколи про заходи, вжиті Прикордонними Уповноваженими, та про їх робочі наради;
f) вирішують питання, щодо яких Прикордонні Уповноважені не дійшли згоди, а також ті, що не входять до компетенції Прикордонних Уповноважених;
g) встановлюють зразки документів, які використовуються у спільній діяльності Прикордонних Уповноважених;
h) передають на вирішення по дипломатичних каналах, повідомляючи свою думку, особливо складні справи, щодо яких вони не дійшли взаємної згоди.