Формою роботи Міжвідомчої робочої групи є засідання, що проводяться за рішенням її голови.
Засідання Міжвідомчої робочої групи веде голова, а за його відсутності - заступник.
Підготовку матеріалів для розгляду на засіданнях Міжвідомчої робочої групи забезпечує її секретар.
Засідання Міжвідомчої робочої групи вважається правоможним, якщо на ньому присутні більш як половина її членів.
Дата і спосіб проведення засідання та порядок денний повідомляються членам Міжвідомчої робочої групи не пізніше ніж за три робочих дні до засідання.
Голова Міжвідомчої робочої групи може прийняти рішення про проведення засідання у режимі реального часу з використанням відповідних технічних засобів, зокрема через Інтернет, або про участь члена Міжвідомчої робочої групи в такому режимі у засіданні.