Керівник Служби:
1) здійснює заходи щодо державної реєстрації Служби відповідно до Закону України “Про державну реєстрацію юридичних осіб, фізичних осіб - підприємців та громадських формувань”;
2) подає на погодження освітньому омбудсмену і затвердження МОН положення про Службу, структуру, кошторис, штатний розпис на відповідний рік та зміни до них;
3) забезпечує взаємодію Служби з МОН;
4) організовує роботу, здійснює загальне керівництво діяльністю Служби та забезпечує виконання її завдань;
5) приймає рішення щодо призначення і звільнення з посади працівників Служби, заохочення та притягнення їх до дисциплінарної відповідальності;
6) затверджує положення про самостійні структурні підрозділи Служби;
7) забезпечує дотримання працівниками Служби законодавства про працю, правил внутрішнього трудового розпорядку;
8) забезпечує взаємодію Служби та її структурних підрозділів з державними органами і органами місцевого самоврядування;
9) представляє Службу як юридичну особу в цивільно-правових відносинах, у судах, інших державних органах і органах місцевого самоврядування;
10) дає у межах повноважень обов’язкові для виконання працівниками Служби доручення;
11) організовує проведення нарад з питань, що належать до його компетенції;
12) розподіляє функціональні обов’язки між працівниками Служби;
13) здійснює інші повноваження, визначені законодавством.