Агентство під час реалізації функцій у сфері кваліфікацій взаємодіє з Кабінетом Міністрів України, МОН, Мінекономіки, іншими центральними та місцевими органами виконавчої влади, органами місцевого самоврядування, спільним представницьким органом всеукраїнських об’єднань організацій роботодавців та спільним представницьким органом репрезентативних всеукраїнських об’єднань профспілок, всеукраїнськими об’єднаннями організацій роботодавців та всеукраїнськими об’єднаннями профспілок, галузевими об’єднаннями організацій роботодавців, торгово-промисловими палатами, галузевими об’єднаннями профспілкових організацій, галузевими (професійними) радами з кваліфікацій, всеукраїнськими професійними асоціаціями, іншими громадськими об’єднаннями, органами та установами забезпечення якості освіти, підприємствами, установами та організаціями, міжнародними та зарубіжними організаціями у сфері кваліфікацій.