Організаційне, фінансово-господарське, матеріально-технічне, інформаційно-довідкове та інше забезпечення діяльності Агентства та його комітетів здійснює секретаріат Агентства.
Положення про секретаріат Агентства, його структура і штатний розпис затверджуються рішенням Агентства.