Голова Укрфармагентства має заступників, які призначаються та звільняються з посади Кабінетом Міністрів України відповідно до законодавства про державну службу.
Кількість заступників Голови Укрфармагентства визначається Кабінетом Міністрів України на основі обґрунтованого подання Голови Укрфармагентства.