Національна комісія виконує функції охорони психічного здоров’я, визначені Законом України “Про систему охорони психічного здоров’я в Україні”.
Під час виконання своїх функцій у сфері охорони психічного здоров’я Національна комісія взаємодіє з Кабінетом Міністрів України, МОЗ, Мінсоцполітики, МОН, Міноборони, МВС, Мінветеранів, іншими центральними та місцевими органами виконавчої влади, органами місцевого самоврядування, саморегулівними організаціями у сфері психічного здоров’я (далі - саморегулівні організації), громадськими об’єднаннями надавачів послуг у сфері психічного здоров’я та фахівцями у сфері психічного здоров’ я, іншими громадськими об’єднаннями, юридичними особами незалежно від організаційно-правової форми, отримувачами послуг і допомоги у сфері психічного здоров’я, міжнародними організаціями у сфері психічного здоров’я.