Завданнями секретаріату Національної комісії є:
1) організаційне, правове, експертно-аналітичне, методичне та інформаційне забезпечення діяльності Національної комісії;
2) інформаційно-довідкове забезпечення діяльності Голови Національної комісії, його заступників, членів Національної комісії;
3) забезпечення підготовки і проведення засідань Національної комісії та її комітетів;
4) організація ведення діловодства та архіву відповідно до законодавства;
5) фінансово-господарське та матеріально-технічне забезпечення діяльності Національної комісії;
6) адміністрування та ведення Державного реєстру саморегулівних організацій у сфері психічного здоров’я та Реєстру надавачів послуг у сфері психічного здоров’я;
7) виконання інших завдань, передбачених положенням про секретаріат Національної комісії.